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仕事や研究、コンピューターとの付き合い方

多重検定

割と簡単だったのでメモ

とりあえず multcomp をインストールして、aov で分析して一旦Tukeyで検定してから補正をかけるイメージ。 Shafferが強いと思っていたが、もっと強いのがWestfallだった

res.aov <- aov(outcome ~ treatment, data = df)

res.tukey <- glht(res.aov)

summary(res.tukey, test = adjusted("Shaffer"))
summary(res.tukey, test = adjusted("bonferroni"))
summary(res.tukey, test = adjusted("Westfall"))
summary(res.tukey, test = adjusted("single-step"))